不銹鋼攪拌罐的基本的結構單元包括罐體、機械攪拌系統、通氣系統、溫度控制系統、消泡系統、pH控制系統、取樣口、排空口、清潔和滅菌系統等。
另外，大型反應器一般還需要安裝視鏡、人孔等部件。反應器設計的基本目的就是綜合考慮這些系統之間的相互關系，以充分發揮上述系統的效率。
實驗室小型通氣攪拌罐的罐體一般由耐熱玻璃或不銹鋼制成。雖然普通碳鋼曾是大型通氣攪拌罐罐體的常用材料，現在絕大多數大型通氣攪拌罐罐體都采用不銹鋼制造。這樣可以盡量減輕腐蝕，并減少由此帶來的不必要的金屬離子對發酵液的污染。
總體而言，通氣攪拌罐的設計、安裝過程中應該充分注意避免死角、裂縫等可能在局部位置上妨礙流體混合的瑕疵，以免造成滅菌不徹底或發酵過程中形成微生物膜。避免染菌污染也是通氣攪拌罐的各個系統設計時都應該注意的共性問題。
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